21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4093 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4093  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  668    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0520376  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3032  hypothetical protein  37.01 
 
 
315 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9174  hypothetical protein  35.02 
 
 
323 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9567  hypothetical protein  35.76 
 
 
314 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500039  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4323  hypothetical protein  35.08 
 
 
313 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4759  hypothetical protein  35.42 
 
 
313 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4591  hypothetical protein  37.27 
 
 
168 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8682  hypothetical protein  31.15 
 
 
288 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4218  hypothetical protein  25.96 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.87 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0997  hypothetical protein  20.34 
 
 
285 aa  63.5  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.33 
 
 
276 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.12 
 
 
298 aa  57  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.23 
 
 
270 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.36 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.87 
 
 
257 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.67 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  24.58 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  24.58 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4590  hypothetical protein  39.77 
 
 
91 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0927  hypothetical protein  26.82 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>