23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8682 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8682  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4218  hypothetical protein  60.59 
 
 		 273 aa  322  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4093  hypothetical protein  31.15 
 
 		 322 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0520376  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3032  hypothetical protein  31.25 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9567  hypothetical protein  32.53 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500039  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4759  hypothetical protein  27 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9174  hypothetical protein  28.28 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0997  hypothetical protein  26.64 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407052 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4323  hypothetical protein  29.14 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5198  hypothetical protein  29.61 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.756457 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4591  hypothetical protein  30.87 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5253  hypothetical protein  30.2 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.8 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.4 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.27 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2827  hypothetical protein  30.95 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.556996 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.84 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.33 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.36 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  25 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  25 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.76 
 
 		 368 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>