21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2827 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2827  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.556996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0661  hypothetical protein  58.1 
 
 		 280 aa  321  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.674805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1211  putative phage-related protein  57.04 
 
 		 280 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1652  hypothetical protein  55.99 
 
 		 280 aa  308  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0249  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.05 
 
 		 290 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.819659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2431  putative phage-related protein  43.94 
 
 		 262 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4140  hypothetical protein  34.19 
 
 		 291 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.923339  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0627  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  29.41 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0745757  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4218  hypothetical protein  33.74 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8682  hypothetical protein  30.95 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.04 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  21.83 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00122  putative phage-related protein  27.33 
 
 		 350 aa  49.3  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.7 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  22.99 
 
 		 428 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  23.08 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  23.08 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  22.99 
 
 		 428 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.88 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  23.56 
 
 		 428 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  22.99 
 
 		 428 aa  42.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>