17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1211 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1211  putative phage-related protein  100 
 
 		 280 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0661  hypothetical protein  90 
 
 		 280 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.674805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1652  hypothetical protein  83.93 
 
 		 280 aa  498  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2827  hypothetical protein  55.99 
 
 		 285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.556996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2431  putative phage-related protein  50.71 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0249  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.819659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4140  hypothetical protein  39 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.923339  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0627  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  30 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0745757  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.9 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00122  putative phage-related protein  26.26 
 
 		 350 aa  49.3  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.43 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.21 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4046  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.82 
 
 		 368 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.32 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  35.29 
 
 		 633 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.97 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.2 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>