26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0627 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0627  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  100 
 
 		 290 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0745757  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4140  hypothetical protein  27.64 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.923339  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0249  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.6 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.819659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2827  hypothetical protein  29.41 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.556996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1211  putative phage-related protein  30 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0661  hypothetical protein  30.45 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.674805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1652  hypothetical protein  30.91 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2431  putative phage-related protein  25.31 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  29.59 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.99 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.33 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  27.34 
 
 		 428 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.97 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  27.34 
 
 		 428 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  26.62 
 
 		 441 aa  49.3  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4046  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.97 
 
 		 368 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  26.62 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  26.62 
 
 		 428 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  28.78 
 
 		 633 aa  46.2  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3457  hypothetical protein  25.59 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  27.21 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  27.21 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.81 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00122  putative phage-related protein  28.1 
 
 		 350 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.59 
 
 		 368 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11209  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.78 
 
 		 580 aa  43.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>