19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00122 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00122  putative phage-related protein  100 
 
 		 350 aa  727    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.34 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.47 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4046  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.7 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.87 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  41.29 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  41.29 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.83 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.56 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.91 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.56 
 
 		 278 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.57 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0249  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.5 
 
 		 290 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.819659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1211  putative phage-related protein  26.26 
 
 		 280 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0661  hypothetical protein  25.66 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.674805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2827  hypothetical protein  27.59 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.556996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2431  putative phage-related protein  29 
 
 		 262 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1652  hypothetical protein  36.36 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0627  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  28.1 
 
 		 290 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0745757  normal  0.0460602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>