50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5329 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 		 278 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.76 
 
 		 278 aa  278  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.19 
 
 		 276 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  47.1 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  47.1 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.4 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.24 
 
 		 257 aa  232  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.93 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.8 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4046  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.63 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.28 
 
 		 368 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11209  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00122  putative phage-related protein  38.56 
 
 		 350 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  26.19 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  26.29 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  26.37 
 
 		 634 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  26.64 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  25.4 
 
 		 428 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.92 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.02 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  26.02 
 
 		 441 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  26.61 
 
 		 796 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  26.39 
 
 		 633 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  26.14 
 
 		 878 aa  59.7  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.16 
 
 		 885 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  29.82 
 
 		 594 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  27.36 
 
 		 667 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4218  hypothetical protein  25.78 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  26.37 
 
 		 588 aa  53.1  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  25.59 
 
 		 594 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  27.68 
 
 		 464 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  25 
 
 		 592 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4093  hypothetical protein  26.67 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0520376  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  22.12 
 
 		 466 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  23.88 
 
 		 469 aa  48.9  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  23.81 
 
 		 509 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  27.23 
 
 		 879 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  22.33 
 
 		 469 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.26 
 
 		 580 aa  47  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  27.27 
 
 		 880 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.54 
 
 		 336 aa  46.2  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.53 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8682  hypothetical protein  22.84 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.03 
 
 		 784 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.66 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  25.47 
 
 		 472 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  25.24 
 
 		 614 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  25.73 
 
 		 896 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  24.46 
 
 		 373 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  27.35 
 
 		 512 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  28.23 
 
 		 503 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>