31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4046 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4046  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
368 aa  759    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.22 
 
 
368 aa  515  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.62 
 
 
276 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.42 
 
 
278 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.63 
 
 
278 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.03 
 
 
257 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  47.85 
 
 
280 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  47.85 
 
 
280 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.15 
 
 
279 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00122  putative phage-related protein  31.7 
 
 
350 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.12 
 
 
270 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.83 
 
 
298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  26.22 
 
 
428 aa  53.1  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  29.01 
 
 
428 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  26.71 
 
 
428 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  29.84 
 
 
634 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  27.15 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0627  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  28.97 
 
 
290 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0745757  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.85 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.27 
 
 
363 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1652  hypothetical protein  24.57 
 
 
280 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  30.71 
 
 
588 aa  47  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4218  hypothetical protein  28.75 
 
 
273 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.41 
 
 
335 aa  46.2  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  28.05 
 
 
441 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  31.97 
 
 
592 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  31.36 
 
 
509 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.23 
 
 
784 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1211  putative phage-related protein  24.82 
 
 
280 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  29.13 
 
 
594 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  28.07 
 
 
466 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>