11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9174 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9174  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  662    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4323  hypothetical protein  75.25 
 
 		 313 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9567  hypothetical protein  76.67 
 
 		 314 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500039  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4759  hypothetical protein  77.35 
 
 		 313 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3032  hypothetical protein  73.14 
 
 		 315 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4591  hypothetical protein  68.18 
 
 		 168 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4093  hypothetical protein  35.02 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0520376  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4590  hypothetical protein  79.1 
 
 		 91 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8682  hypothetical protein  28.28 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0997  hypothetical protein  25.26 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4218  hypothetical protein  27.6 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>