More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2089 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  965    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  63.89 
 
 
469 aa  626  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  58.84 
 
 
464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  54.51 
 
 
472 aa  536  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  54.64 
 
 
466 aa  526  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  45.04 
 
 
634 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  44.71 
 
 
633 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  36.13 
 
 
509 aa  349  7e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  36.95 
 
 
512 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  36.59 
 
 
502 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  36.53 
 
 
503 aa  333  5e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.86 
 
 
580 aa  333  6e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  35.62 
 
 
491 aa  330  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  37.3 
 
 
614 aa  263  4e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  33.33 
 
 
667 aa  256  7e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  34.69 
 
 
592 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  35.97 
 
 
594 aa  248  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  34.54 
 
 
594 aa  242  9e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  36.46 
 
 
588 aa  241  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  29.27 
 
 
796 aa  232  9e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  32.59 
 
 
879 aa  232  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.65 
 
 
885 aa  226  6e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  32.52 
 
 
878 aa  224  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  32.23 
 
 
896 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  32.67 
 
 
880 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  27.08 
 
 
428 aa  184  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  27.55 
 
 
441 aa  183  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  28.1 
 
 
428 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  27.62 
 
 
428 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  26.43 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.37 
 
 
421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.1 
 
 
784 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.58 
 
 
723 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0799  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.23 
 
 
755 aa  96.3  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.21 
 
 
235 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.98 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1702  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.82 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.9 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0413  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.81 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.74 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  26.44 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  26.16 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.16 
 
 
226 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.334965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.16 
 
 
226 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1669  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.61 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400633  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.86 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.17 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2192  phosophoadenylyl-sulfate reductase  25.77 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.97 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  26.59 
 
 
522 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  24.58 
 
 
541 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.97 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  25.18 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  27.16 
 
 
507 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.58 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0739  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.59 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00726569  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  26.14 
 
 
566 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2615  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.23 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  24.45 
 
 
538 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.7 
 
 
224 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1147  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.18 
 
 
256 aa  65.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  26.04 
 
 
484 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2468  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.25 
 
 
240 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.614171  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.85 
 
 
220 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.1 
 
 
378 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1567  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.37 
 
 
224 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.779448  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  25.94 
 
 
496 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  25.21 
 
 
495 aa  63.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.94 
 
 
241 aa  63.9  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  28.02 
 
 
551 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1152  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.86 
 
 
251 aa  63.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1789  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  27.87 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000854791  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1300  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  28.86 
 
 
227 aa  63.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.88984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  23.79 
 
 
528 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1501  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  28.88 
 
 
236 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2818  sulfate adenylyltransferase subunit 2  29.1 
 
 
322 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000664267 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.34 
 
 
248 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.09 
 
 
244 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2969  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.47 
 
 
244 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  decreased coverage  0.00395562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  26 
 
 
234 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.86 
 
 
248 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1765  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.28 
 
 
226 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.09 
 
 
244 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.26 
 
 
268 aa  60.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.09 
 
 
244 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0816  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.05 
 
 
249 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.09 
 
 
244 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.09 
 
 
244 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.44 
 
 
342 aa  60.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0216  phosophoadenylyl-sulfate reductase  29.21 
 
 
245 aa  60.5  0.00000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4821  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  30.77 
 
 
229 aa  60.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0796  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.96 
 
 
256 aa  60.1  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4113  Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  27.22 
 
 
250 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2290  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.67 
 
 
237 aa  59.7  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1697  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.66 
 
 
243 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224178  normal  0.181777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2535  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  24.88 
 
 
239 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3123  sulfate adenylyltransferase subunit 2  29.33 
 
 
304 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.478568  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1582  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.62 
 
 
243 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  23.53 
 
 
486 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0821  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.26 
 
 
247 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>