76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1300 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 		 342 aa  700    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.54 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.04 
 
 		 378 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  35.76 
 
 		 522 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  34.97 
 
 		 495 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  34.36 
 
 		 487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  34.32 
 
 		 507 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  32.77 
 
 		 391 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  33.61 
 
 		 486 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  32.06 
 
 		 588 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  32.72 
 
 		 544 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  31.88 
 
 		 538 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  31.62 
 
 		 541 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  31.83 
 
 		 566 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  30.85 
 
 		 551 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  29.69 
 
 		 496 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  32.6 
 
 		 528 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  30.06 
 
 		 518 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  26.25 
 
 		 600 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  26.17 
 
 		 590 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  27.24 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  29.87 
 
 		 663 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  28.78 
 
 		 574 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.44 
 
 		 419 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.35 
 
 		 392 aa  89.7  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  25.87 
 
 		 600 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.99 
 
 		 803 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.62 
 
 		 612 aa  73.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.55 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  24.05 
 
 		 604 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0022  hypothetical protein  24.43 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0523508  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  23.66 
 
 		 817 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  27.21 
 
 		 607 aa  66.6  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  25.49 
 
 		 597 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  24.1 
 
 		 632 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  25.11 
 
 		 633 aa  62.8  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  25.97 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  23.35 
 
 		 598 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  26.44 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  25.63 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  25.78 
 
 		 634 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  27.03 
 
 		 503 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.13 
 
 		 608 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  25.71 
 
 		 491 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.51 
 
 		 580 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  26.58 
 
 		 512 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  24.19 
 
 		 469 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  25.6 
 
 		 464 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  26.95 
 
 		 472 aa  53.1  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  25.59 
 
 		 502 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  27.85 
 
 		 667 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  28.43 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.67 
 
 		 723 aa  49.7  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  24.71 
 
 		 588 aa  49.3  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  28.16 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  24.12 
 
 		 466 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  29.38 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0006  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  23.6 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000392553  hitchhiker  0.000000249186 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  26.2 
 
 		 592 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.06 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  26.57 
 
 		 880 aa  46.2  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  24 
 
 		 614 aa  46.2  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  28.14 
 
 		 428 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.91 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1702  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.46 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1789  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  25.14 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000854791  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.29 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  26.97 
 
 		 441 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  27.21 
 
 		 796 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  26.14 
 
 		 878 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.74 
 
 		 278 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02176  hypothetical protein  23.41 
 
 		 416 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.219036 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  23.68 
 
 		 594 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.57 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  27.48 
 
 		 879 aa  43.1  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>