77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2306 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1220    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  64.01 
 
 		 544 aa  692    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  42.72 
 
 		 495 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  43.36 
 
 		 487 aa  426  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  41.94 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  37.89 
 
 		 507 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  39.66 
 
 		 538 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  39.79 
 
 		 566 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  35.9 
 
 		 522 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  39.37 
 
 		 518 aa  330  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  38.74 
 
 		 528 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  39.08 
 
 		 541 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  38.32 
 
 		 551 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  36.83 
 
 		 484 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  33.95 
 
 		 496 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  37.12 
 
 		 391 aa  264  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.11 
 
 		 378 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.06 
 
 		 342 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  28.25 
 
 		 590 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  28.02 
 
 		 600 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  30.28 
 
 		 310 aa  150  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.99 
 
 		 335 aa  146  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  27.98 
 
 		 663 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  27.12 
 
 		 604 aa  101  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  28.35 
 
 		 817 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  27.8 
 
 		 600 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  26.91 
 
 		 632 aa  93.6  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.89 
 
 		 392 aa  90.9  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.7 
 
 		 803 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0022  hypothetical protein  24.68 
 
 		 388 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0523508  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.7 
 
 		 608 aa  87  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  25.26 
 
 		 574 aa  84.7  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.17 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.64 
 
 		 612 aa  77  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  23.69 
 
 		 607 aa  73.6  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  25.13 
 
 		 592 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.83 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  26.5 
 
 		 597 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  29.32 
 
 		 597 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  26.42 
 
 		 594 aa  65.5  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.65 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  27.23 
 
 		 633 aa  64.3  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  24.87 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  28.02 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  25.37 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  25.89 
 
 		 594 aa  60.8  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  30 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  26.67 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  26.6 
 
 		 598 aa  59.3  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  24.9 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  28.85 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  26.46 
 
 		 428 aa  55.5  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.67 
 
 		 334 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  26.82 
 
 		 491 aa  54.7  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  23.65 
 
 		 503 aa  54.3  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  26.92 
 
 		 667 aa  53.9  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  29.23 
 
 		 428 aa  53.9  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  29.14 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  30.14 
 
 		 280 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  30.14 
 
 		 280 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.13 
 
 		 580 aa  52.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  25.84 
 
 		 469 aa  50.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  28.12 
 
 		 464 aa  49.3  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  25.14 
 
 		 634 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  28.35 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.23 
 
 		 784 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  26.15 
 
 		 614 aa  47.8  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25 
 
 		 319 aa  47.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.84 
 
 		 298 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  24.87 
 
 		 469 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0336  hypothetical protein  25.68 
 
 		 341 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  27.18 
 
 		 796 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.54 
 
 		 284 aa  44.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.41 
 
 		 278 aa  44.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.01 
 
 		 257 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.67 
 
 		 276 aa  43.9  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.9 
 
 		 279 aa  43.9  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>