33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0336 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0336  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  712    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5004  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.76 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  0.549509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1301  hypothetical protein  53.82 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4322  hypothetical protein  52.16 
 
 		 348 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2724  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.41 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.548839 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0006  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  43.48 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000392553  hitchhiker  0.000000249186 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4126  hypothetical protein  43.46 
 
 		 213 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4117  hypothetical protein  42.86 
 
 		 165 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.24 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.81 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  25.3 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3838  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.91 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0614264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.03 
 
 		 430 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0220762  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.68 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.67 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  24.11 
 
 		 428 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  24.21 
 
 		 428 aa  52.8  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  24.11 
 
 		 428 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5428  hypothetical protein  25.62 
 
 		 404 aa  49.3  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  25 
 
 		 484 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  25.9 
 
 		 633 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  25.84 
 
 		 528 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  27.27 
 
 		 634 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.85 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  25.68 
 
 		 588 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1030  gp57  32.53 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  23.01 
 
 		 496 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  23.38 
 
 		 614 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  25.15 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  25 
 
 		 551 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.77 
 
 		 421 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  22.98 
 
 		 796 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  22.37 
 
 		 469 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>