69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0739 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  67.73 
 
 		 484 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  1025    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  47.86 
 
 		 551 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  45.73 
 
 		 507 aa  428  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  47.66 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  45.49 
 
 		 518 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  44.58 
 
 		 538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  46.25 
 
 		 541 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  44.17 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  43.81 
 
 		 487 aa  364  2e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  41.9 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  42.32 
 
 		 495 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  34.86 
 
 		 544 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  33.95 
 
 		 588 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  34.18 
 
 		 522 aa  276  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.99 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  34.51 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.24 
 
 		 335 aa  170  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.69 
 
 		 342 aa  166  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  28.78 
 
 		 600 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  28.61 
 
 		 590 aa  150  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  31.41 
 
 		 310 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  28.16 
 
 		 663 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  29.86 
 
 		 574 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  28.87 
 
 		 607 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  30.06 
 
 		 604 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.23 
 
 		 608 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.9 
 
 		 803 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  27.97 
 
 		 817 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  26.8 
 
 		 600 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  26.24 
 
 		 632 aa  90.1  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  26.38 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  26.6 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.56 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  29.32 
 
 		 598 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.63 
 
 		 612 aa  75.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0022  hypothetical protein  21.63 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0523508  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.36 
 
 		 419 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  27 
 
 		 464 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  25 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  25.94 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  27.03 
 
 		 592 aa  60.5  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  25.96 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  24.83 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  26.05 
 
 		 594 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  25.5 
 
 		 588 aa  58.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  26.72 
 
 		 512 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.04 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  26.42 
 
 		 634 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  25.59 
 
 		 594 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  24.89 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  24.2 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.03 
 
 		 334 aa  57  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  23.91 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  25.86 
 
 		 503 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6216  hypothetical protein  25.38 
 
 		 496 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  24.29 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  23.91 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  29 
 
 		 502 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  25 
 
 		 633 aa  54.3  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  24.23 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  20.22 
 
 		 531 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  25.5 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  27.72 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  25.62 
 
 		 614 aa  52  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.45 
 
 		 421 aa  47  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  21.95 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0336  hypothetical protein  23.01 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  23.08 
 
 		 796 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>