30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2713 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
334 aa  681    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  70.23 
 
 
419 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.5 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  24.68 
 
 
522 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  26.45 
 
 
484 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.55 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  26.13 
 
 
518 aa  69.3  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  26.43 
 
 
495 aa  69.3  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  25.66 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  26.76 
 
 
486 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  24.44 
 
 
551 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.92 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  25.75 
 
 
507 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  28.23 
 
 
391 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  31.82 
 
 
544 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  28.16 
 
 
588 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  27.57 
 
 
496 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  23.72 
 
 
538 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  25.32 
 
 
566 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  22.62 
 
 
541 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  25.76 
 
 
600 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  21.99 
 
 
574 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  29.76 
 
 
310 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  29.76 
 
 
600 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.3 
 
 
803 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  29.76 
 
 
590 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.54 
 
 
392 aa  46.2  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  22.59 
 
 
509 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  23.66 
 
 
528 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  23.88 
 
 
469 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>