39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5743 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
419 aa  840    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  69.23 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.41 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.44 
 
 
342 aa  93.2  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  29.68 
 
 
495 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  30.26 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  28.36 
 
 
522 aa  87  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.45 
 
 
378 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  26.17 
 
 
588 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  24.67 
 
 
487 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  27.34 
 
 
518 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  25.26 
 
 
496 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  24.87 
 
 
486 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  25.82 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  28.88 
 
 
544 aa  73.6  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  27.04 
 
 
541 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  29.24 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  27.84 
 
 
574 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  25.86 
 
 
538 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  25.06 
 
 
507 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.15 
 
 
803 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  26.39 
 
 
566 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.22 
 
 
531 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  24.85 
 
 
604 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  24.7 
 
 
590 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.28 
 
 
392 aa  53.1  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  27.27 
 
 
310 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  24.7 
 
 
600 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  26.73 
 
 
817 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  24.27 
 
 
600 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  24.31 
 
 
663 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  26.13 
 
 
632 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  26.03 
 
 
528 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.97 
 
 
723 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.43 
 
 
612 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  28.68 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  28.68 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.44 
 
 
608 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  24.05 
 
 
634 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>