63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0359 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  1000    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  79.26 
 
 
486 aa  806    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  57.6 
 
 
495 aa  561  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  43.36 
 
 
588 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  46.55 
 
 
507 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  44.96 
 
 
551 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  45.72 
 
 
528 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  43.07 
 
 
544 aa  405  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  44.47 
 
 
518 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  44.01 
 
 
538 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  45.49 
 
 
566 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  44.25 
 
 
484 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  43.36 
 
 
541 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  38.39 
 
 
522 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  43.81 
 
 
496 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  38.25 
 
 
391 aa  286  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.91 
 
 
378 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.36 
 
 
342 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.54 
 
 
335 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  30.39 
 
 
600 aa  163  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  30.45 
 
 
590 aa  163  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  33.33 
 
 
310 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  29.64 
 
 
663 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  28.01 
 
 
574 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  32.16 
 
 
600 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  30.72 
 
 
632 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.57 
 
 
803 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  27.8 
 
 
604 aa  96.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  31.23 
 
 
817 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.12 
 
 
612 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0022  hypothetical protein  23.12 
 
 
388 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0523508  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  26.52 
 
 
607 aa  87.8  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  23.89 
 
 
598 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.77 
 
 
608 aa  81.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.79 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  26.57 
 
 
597 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.83 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  27 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.25 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25 
 
 
531 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  24.15 
 
 
597 aa  60.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  23.53 
 
 
469 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  29.1 
 
 
472 aa  58.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.38 
 
 
580 aa  57.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  25.38 
 
 
509 aa  56.6  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  23.55 
 
 
512 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  25.19 
 
 
491 aa  54.3  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  22.4 
 
 
633 aa  53.9  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  24.86 
 
 
667 aa  53.5  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  21.49 
 
 
466 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  24.03 
 
 
464 aa  51.2  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  25.22 
 
 
634 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  23.57 
 
 
592 aa  50.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  24.8 
 
 
502 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  23.14 
 
 
503 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  26.89 
 
 
491 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  23.5 
 
 
594 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  24.23 
 
 
588 aa  47  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  23.95 
 
 
614 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  24.9 
 
 
428 aa  45.8  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.66 
 
 
723 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  24.15 
 
 
796 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  23.23 
 
 
594 aa  43.5  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>