39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4362 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
531 aa  1105    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  24.86 
 
 
574 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.55 
 
 
803 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  23.73 
 
 
597 aa  94  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  25.59 
 
 
632 aa  92.8  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.93 
 
 
608 aa  91.3  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  22.83 
 
 
607 aa  90.5  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  23.74 
 
 
600 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  25 
 
 
604 aa  87  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  23.04 
 
 
598 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  22.74 
 
 
597 aa  84.7  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.51 
 
 
612 aa  84.7  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  26.46 
 
 
566 aa  77.4  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.52 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  26.07 
 
 
528 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  24.35 
 
 
491 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25 
 
 
378 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  26.04 
 
 
538 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  24.66 
 
 
817 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  24.02 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  23.31 
 
 
507 aa  70.5  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  24.92 
 
 
486 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  24.62 
 
 
518 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  25.83 
 
 
588 aa  66.6  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  24.05 
 
 
663 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  25 
 
 
487 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  28.85 
 
 
544 aa  65.1  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6216  hypothetical protein  21.92 
 
 
496 aa  65.1  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  24.22 
 
 
541 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  24.68 
 
 
590 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  24.68 
 
 
600 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.91 
 
 
419 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  25.6 
 
 
391 aa  57.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  24.55 
 
 
310 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  28.28 
 
 
551 aa  57.4  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  23.38 
 
 
484 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  22.93 
 
 
522 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  20.22 
 
 
496 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.45 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>