41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0317 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  57.74 
 
 
597 aa  722    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  100 
 
 
607 aa  1259    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  53.87 
 
 
597 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  57.72 
 
 
608 aa  726    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  52.01 
 
 
598 aa  645    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  55.56 
 
 
491 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6216  hypothetical protein  54.41 
 
 
496 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  36.4 
 
 
574 aa  326  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  30.4 
 
 
632 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.67 
 
 
803 aa  185  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  29.69 
 
 
600 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  26.33 
 
 
817 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  26.56 
 
 
604 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.06 
 
 
612 aa  156  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5990  hypothetical protein  51.26 
 
 
127 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  29.86 
 
 
495 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  25.94 
 
 
522 aa  107  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  27.4 
 
 
566 aa  107  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  28.32 
 
 
551 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  27.99 
 
 
538 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.3 
 
 
378 aa  105  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  28.87 
 
 
496 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  27.19 
 
 
518 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  27.1 
 
 
541 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  28.62 
 
 
484 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  27.27 
 
 
507 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  26.4 
 
 
391 aa  91.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.83 
 
 
531 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  26.52 
 
 
487 aa  87.8  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  27.84 
 
 
528 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  26.05 
 
 
600 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  22.95 
 
 
663 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  27.21 
 
 
486 aa  84.7  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  26.06 
 
 
310 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  25.72 
 
 
590 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  23.69 
 
 
588 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  24.47 
 
 
544 aa  70.9  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.21 
 
 
342 aa  66.6  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.61 
 
 
335 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.71 
 
 
392 aa  54.7  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  25.46 
 
 
428 aa  44.3  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>