35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1725 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6216  hypothetical protein  66.39 
 
 		 496 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  1013    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  59.57 
 
 		 597 aa  587  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  55.56 
 
 		 607 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  57.02 
 
 		 608 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  54.47 
 
 		 598 aa  524  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  52.02 
 
 		 597 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  36.68 
 
 		 574 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  30.28 
 
 		 632 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  29.23 
 
 		 817 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  31.9 
 
 		 600 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  29.32 
 
 		 604 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5990  hypothetical protein  60.36 
 
 		 127 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.12 
 
 		 803 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.32 
 
 		 612 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.35 
 
 		 531 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  27.35 
 
 		 518 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  27.46 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  28.93 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  29.08 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  29.08 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.26 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  24.2 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  24.88 
 
 		 663 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  25.62 
 
 		 538 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  25.19 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  26.67 
 
 		 391 aa  53.5  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  28.26 
 
 		 528 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  26.33 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  26.7 
 
 		 484 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  28 
 
 		 495 aa  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  25.76 
 
 		 600 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  26 
 
 		 310 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  25.25 
 
 		 590 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.83 
 
 		 284 aa  43.5  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>