62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1368 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  79.26 
 
 
487 aa  806    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  1011    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  56.1 
 
 
495 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  41.94 
 
 
588 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  44.92 
 
 
507 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  43.58 
 
 
544 aa  401  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  45.09 
 
 
551 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  45.55 
 
 
528 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  45.96 
 
 
518 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  44.16 
 
 
538 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  43.55 
 
 
566 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  39.76 
 
 
522 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  42.67 
 
 
541 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  42.61 
 
 
484 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  41.9 
 
 
496 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  38.2 
 
 
391 aa  276  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.71 
 
 
378 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.61 
 
 
342 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.8 
 
 
335 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  29.19 
 
 
600 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  28.95 
 
 
590 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  33.33 
 
 
310 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  26.91 
 
 
663 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  32.38 
 
 
600 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  31.74 
 
 
632 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  30.94 
 
 
817 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.31 
 
 
612 aa  94.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  27.08 
 
 
604 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.43 
 
 
608 aa  90.5  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  27.65 
 
 
574 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0022  hypothetical protein  24.38 
 
 
388 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0523508  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  27.21 
 
 
607 aa  84.7  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.91 
 
 
803 aa  83.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  23.63 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.14 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.42 
 
 
392 aa  73.2  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.92 
 
 
531 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  23.91 
 
 
597 aa  67  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  25.37 
 
 
597 aa  67  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.08 
 
 
334 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  25.37 
 
 
469 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  25.53 
 
 
509 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  23.53 
 
 
469 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  22.51 
 
 
466 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  25.93 
 
 
472 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  24.28 
 
 
464 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.23 
 
 
580 aa  54.3  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  21.77 
 
 
633 aa  53.5  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  25.82 
 
 
667 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  26.33 
 
 
491 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  24.5 
 
 
592 aa  52  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  24.02 
 
 
512 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.82 
 
 
723 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  24.08 
 
 
634 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  23.74 
 
 
594 aa  50.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  24 
 
 
588 aa  49.7  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  23.85 
 
 
491 aa  47.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  23.14 
 
 
503 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  25.31 
 
 
614 aa  47  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  23.74 
 
 
594 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  23.44 
 
 
796 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  23.08 
 
 
502 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.882321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>