40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0129 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  100 
 
 		 817 aa  1706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  31.81 
 
 		 604 aa  248  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  30 
 
 		 632 aa  242  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  29.38 
 
 		 600 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.09 
 
 		 803 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  29.84 
 
 		 574 aa  208  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.92 
 
 		 608 aa  203  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  30.1 
 
 		 597 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  28 
 
 		 597 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  29.53 
 
 		 598 aa  190  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  26.26 
 
 		 607 aa  173  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6216  hypothetical protein  29.58 
 
 		 496 aa  163  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  29.23 
 
 		 491 aa  160  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.45 
 
 		 378 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  27.79 
 
 		 507 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  28.15 
 
 		 588 aa  101  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  28.77 
 
 		 566 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  29.86 
 
 		 486 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  28.21 
 
 		 484 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  26.89 
 
 		 496 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  27.55 
 
 		 538 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  29.97 
 
 		 551 aa  94  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  29.81 
 
 		 495 aa  92.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  26.29 
 
 		 518 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  27.72 
 
 		 528 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  28.39 
 
 		 522 aa  92  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.62 
 
 		 612 aa  91.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  31.23 
 
 		 487 aa  91.3  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  26.87 
 
 		 541 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  28.9 
 
 		 544 aa  87.4  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  27.54 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  27.05 
 
 		 600 aa  78.2  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  27.05 
 
 		 310 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.88 
 
 		 531 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  25.81 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.18 
 
 		 342 aa  70.1  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.37 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  26.1 
 
 		 663 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.89 
 
 		 335 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.73 
 
 		 419 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>