33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0153 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0153  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 		 353 aa  712    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327935  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.64 
 
 		 421 aa  53.9  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  26.2 
 
 		 428 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  27.98 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  26.8 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  26.42 
 
 		 428 aa  52.8  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  29.36 
 
 		 614 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  25.27 
 
 		 441 aa  50.1  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  29.1 
 
 		 594 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  27.89 
 
 		 274 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.37 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  27.36 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  27.36 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  28.79 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  26.89 
 
 		 274 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  26.89 
 
 		 274 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  27.13 
 
 		 274 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  26.84 
 
 		 274 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.1 
 
 		 723 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  29.55 
 
 		 588 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1030  gp57  35.42 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  32.14 
 
 		 314 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  33.82 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  26.09 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.39 
 
 		 580 aa  43.9  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  25.12 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  33.98 
 
 		 507 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  33.03 
 
 		 317 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.68 
 
 		 270 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  28.49 
 
 		 880 aa  43.1  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.66 
 
 		 284 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  33.04 
 
 		 274 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  33.04 
 
 		 274 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>