More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1487 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  650    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  40.13 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  34.2 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  37.25 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  35.2 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  36.96 
 
 		 297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  35.88 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  36.31 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  35.76 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  35.92 
 
 		 304 aa  175  9e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  35.1 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  35.2 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  35.6 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  34.87 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  33.01 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  36.01 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  35.31 
 
 		 300 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  32.91 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  34.09 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  33.12 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  33.66 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  33.77 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  33.12 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  32.48 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  33.66 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  31.92 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  31.72 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  31.15 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  32.48 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  31.01 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  31.75 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  30.06 
 
 		 363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  30.91 
 
 		 337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  29.02 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  29.22 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  29.81 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  30.82 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  31.23 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  28.16 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  30.34 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  29.05 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  30.1 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  29.77 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  27.66 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  32.74 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  31.11 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  29.01 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  29.45 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  27.95 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  29.13 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  28.25 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  28.52 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  28.25 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  31.6 
 
 		 422 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  32.66 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  30.04 
 
 		 259 aa  106  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  31.07 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  30.04 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  29.76 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  28.14 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  28.29 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  27.27 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  31.56 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  31.68 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  27.82 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  33.01 
 
 		 280 aa  97.4  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  32.66 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  28.21 
 
 		 287 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  29.05 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  28.4 
 
 		 256 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  32.16 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  28.4 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  30.69 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  31.25 
 
 		 252 aa  93.2  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  32.84 
 
 		 274 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  31.07 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  32.84 
 
 		 274 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  31.07 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  31.19 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  31.07 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  31.19 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  31.19 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  31.19 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  32.35 
 
 		 274 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  30.69 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  32.18 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  31.07 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  31.07 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  32.84 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  29.8 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  30.69 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  31.07 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  30.69 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  30.69 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  31.55 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  29.39 
 
 		 289 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  30.69 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  27.13 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  32.49 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  32.49 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>