292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2277 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  100 
 
 		 303 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  80.6 
 
 		 303 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  76.17 
 
 		 311 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  73.42 
 
 		 302 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  56.95 
 
 		 312 aa  347  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  55.85 
 
 		 299 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  45.48 
 
 		 304 aa  256  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  44.93 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  43.75 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  40.68 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  43.1 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  37.71 
 
 		 323 aa  215  5.9999999999999996e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  39.12 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  40.54 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  37.09 
 
 		 304 aa  195  6e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  39.67 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  37.5 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  38.28 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  32.91 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  31.89 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  31.8 
 
 		 287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  32.55 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  31.13 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  29.93 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  34.06 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  31.48 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  29.64 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  28.62 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  28.62 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  30.25 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  27.83 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  28.57 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  29.17 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  27.39 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  27.04 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  27.96 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  28.34 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  27.96 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  30.11 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  28.05 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  29.25 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  27.86 
 
 		 319 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  28.3 
 
 		 329 aa  92.8  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  28.3 
 
 		 330 aa  92.8  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  28.39 
 
 		 337 aa  91.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  29.39 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  28.06 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  28.9 
 
 		 376 aa  90.1  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  28.52 
 
 		 343 aa  89  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  27.97 
 
 		 422 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  26.69 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  25.58 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  26.09 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  27.33 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  26.54 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  24.42 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  27.73 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  24.58 
 
 		 247 aa  72  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  29.52 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2871  C32 tRNA thiolase  27.85 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.77837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0454  hypothetical protein  30.46 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0339442  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  27.17 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  26.61 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  26.61 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  27.17 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  25.43 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  25.43 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  25.43 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  25.43 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  25.43 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  25.43 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  25.43 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  24.57 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  25.91 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  25.45 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  25.43 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  24.49 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  25.45 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1512  C32 tRNA thiolase  27.11 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.8984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  24.57 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0330  C32 tRNA thiolase  27.91 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  24.14 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  23.72 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  24.14 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  27.87 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  27.96 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1931  C32 tRNA thiolase  27.11 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  30.22 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  27.87 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  24.55 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  24.55 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  26.61 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  26.01 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  26.8 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  28.42 
 
 		 252 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  26.01 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  24.09 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  29.2 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  26.91 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  24.78 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>