More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0105 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  628  1e-179  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  36.79 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  37.46 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  32.25 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  32.25 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  30.72 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  30.67 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  35.48 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  34.62 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  33.55 
 
 		 300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  30.23 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  35.88 
 
 		 328 aa  178  9e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  33 
 
 		 311 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  32.34 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  31.46 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  35.26 
 
 		 327 aa  175  7e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  32.33 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  34.9 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  30.1 
 
 		 326 aa  170  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  28.53 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  32.34 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  33.88 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  29.25 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  27.95 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  33.01 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  31.67 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  27.84 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  31.83 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  30.99 
 
 		 363 aa  156  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  32.07 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  32.19 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  33.11 
 
 		 300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  30.32 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  27.78 
 
 		 376 aa  141  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  31.01 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  28.24 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  31.13 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  29.28 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  28.62 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  28.95 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  30.52 
 
 		 313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  29.63 
 
 		 422 aa  133  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  29.03 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  29.61 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  31.13 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  31.13 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  29.51 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  28.76 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  26.4 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  27.42 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  27.39 
 
 		 323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  27.1 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  26.73 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  27.61 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  28.68 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  25.41 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  26.09 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  29.87 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  26.09 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  26.84 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  25.72 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  26.09 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  27.35 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  29.05 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  28.99 
 
 		 244 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  28.99 
 
 		 244 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  25.36 
 
 		 340 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 289 aa  99  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  25.72 
 
 		 331 aa  99  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  26.14 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  27.47 
 
 		 282 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  28.39 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  26.09 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  28.28 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  29.15 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  26.69 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  27.92 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  28.51 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  28.51 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  28.51 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  27.52 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  29.48 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  28.1 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  27.6 
 
 		 315 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  28.1 
 
 		 311 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  29.36 
 
 		 260 aa  95.5  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  26.61 
 
 		 290 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  28.1 
 
 		 311 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  25.9 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  25.9 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  27.62 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  23.85 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  27.08 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  27.6 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  28.1 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  25.99 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>