More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1652 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  100 
 
 
323 aa  659    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  65.5 
 
 
315 aa  444  1.0000000000000001e-124  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  38.54 
 
 
311 aa  209  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  39.87 
 
 
302 aa  202  6e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  35.37 
 
 
302 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  35.6 
 
 
308 aa  185  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  35.6 
 
 
308 aa  185  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  38.01 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  33.04 
 
 
337 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  36.89 
 
 
326 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  35.8 
 
 
319 aa  179  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  35.19 
 
 
319 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  33.33 
 
 
311 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  33.03 
 
 
321 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  33.65 
 
 
311 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  33.23 
 
 
311 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  33.01 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  34.16 
 
 
327 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  31.94 
 
 
332 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  31.27 
 
 
332 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  31.99 
 
 
329 aa  157  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  29.79 
 
 
326 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  34.84 
 
 
328 aa  155  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  33.21 
 
 
422 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  35.33 
 
 
315 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  31.83 
 
 
330 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  31.03 
 
 
363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  32.68 
 
 
300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  31.01 
 
 
304 aa  149  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  35.16 
 
 
309 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  34.29 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  34.85 
 
 
300 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  30.48 
 
 
376 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  30.97 
 
 
301 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  31.76 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  30.3 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  30.65 
 
 
302 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  30.82 
 
 
318 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  31.51 
 
 
311 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  30.25 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  27.53 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  27.78 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  28.8 
 
 
299 aa  113  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  28.3 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  30.52 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  27.27 
 
 
310 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  28.43 
 
 
323 aa  105  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  27.87 
 
 
307 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  34.08 
 
 
304 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  30.62 
 
 
287 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  33.12 
 
 
304 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  29.06 
 
 
297 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  27.62 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  28.06 
 
 
288 aa  96.7  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  26.29 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  26 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  25.6 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  26 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  26 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  26.78 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  25.69 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  26.64 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  26.29 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  26 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  26.7 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  27.43 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  26.56 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  25.1 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  26.07 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  25.94 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  25.94 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  25.94 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  25.94 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  25.94 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  27.12 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  25.94 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  25.94 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  25.94 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  24.4 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  25.86 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  27.12 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  26.43 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  25.31 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  28.05 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  28.05 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  25.89 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  25.89 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  25.21 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  26.24 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  26.98 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  26.75 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  25.89 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  25.89 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  25.89 
 
 
311 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  25.32 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  25.89 
 
 
311 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  24.77 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  25.85 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  25.89 
 
 
311 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  25.33 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>