285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1006 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 323 aa  673    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  51.16 
 
 		 304 aa  316  4e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  51.16 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  44.67 
 
 		 300 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  43.73 
 
 		 301 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  42.28 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  43 
 
 		 318 aa  255  8e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  40 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  39.39 
 
 		 312 aa  235  8e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  38.08 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  37.67 
 
 		 302 aa  219  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  37.62 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  37.71 
 
 		 303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  36.49 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  36.82 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  35.37 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  34.56 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  35.2 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  33.45 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  34.44 
 
 		 288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  35.64 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  32.69 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  32.78 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  31.31 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  33 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  30.79 
 
 		 326 aa  149  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  30.43 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  31.86 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  29.06 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  29.39 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  30.03 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  26.35 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  28.25 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  26.67 
 
 		 326 aa  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  28.75 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  28 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  28.85 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  26.84 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  27.39 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  26.27 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  28.41 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  27.65 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  24.4 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  27.62 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  24.14 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  28.43 
 
 		 323 aa  105  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  27.27 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  26.56 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  24.84 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  22.73 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  24.84 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  25.81 
 
 		 311 aa  99.4  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  29.44 
 
 		 252 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  26.62 
 
 		 311 aa  95.9  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  25.66 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  28.51 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  24.31 
 
 		 422 aa  92.8  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  25.86 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  25.86 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  29.79 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  28.46 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  26.83 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  25.32 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  26.47 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  28.69 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  28.83 
 
 		 243 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  26.64 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  25.64 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  26.49 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  25.33 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  28.97 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  27.57 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  27.5 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  26.27 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  26.53 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  25.64 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  26.41 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  26.41 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  28.57 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  26.53 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  26.12 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  28.64 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  25.65 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  26.75 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1931  C32 tRNA thiolase  27.12 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  26.41 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  28.32 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  28.14 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  28.14 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  29.15 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  28.14 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  24.46 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  29.06 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  29 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0825  C32 tRNA thiolase  27.31 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.10895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  28.64 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0731  PP-loop domain protein  27.66 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  26.89 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>