More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2367 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  100 
 
 		 247 aa  507  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  49.59 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  48.66 
 
 		 235 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  46.88 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  47.32 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  45.15 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  48.05 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  48.43 
 
 		 244 aa  219  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  44.3 
 
 		 240 aa  214  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  48.42 
 
 		 242 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  42.92 
 
 		 244 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  42.92 
 
 		 244 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  40.35 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  37.33 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  36.79 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  36.71 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  39.09 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  38.33 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  36.8 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  35.91 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  36.49 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  36.92 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  37.05 
 
 		 255 aa  144  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  37.05 
 
 		 255 aa  144  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0731  PP-loop domain protein  35.16 
 
 		 286 aa  143  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  33.62 
 
 		 316 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  37.56 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  37.56 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  34.4 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0182  PP-loop domain-containing protein  37.04 
 
 		 288 aa  141  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  34 
 
 		 251 aa  141  9e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  36.92 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  34.02 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1746  PP-loop family protein  35.22 
 
 		 345 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0604543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1477  PP-loop family protein  35.22 
 
 		 345 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170101  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  32.92 
 
 		 314 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  34.85 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  34.85 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  34.85 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  36.49 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  36.12 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  34.68 
 
 		 307 aa  138  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  34.51 
 
 		 312 aa  138  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 310 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 310 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0125  PP-loop family protein  33.6 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.658918  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 322 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 310 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  31.82 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  35.02 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  34.67 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  34.6 
 
 		 312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  36 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  32.37 
 
 		 317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  31.67 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  31.87 
 
 		 319 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1698  PP-loop domain protein  37.95 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  32.78 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  34.82 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2223  PP-loop domain-containing protein  31.46 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  33.2 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  34.23 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  32.37 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  33.48 
 
 		 314 aa  132  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  34.38 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  33.89 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0207  putative cell cycle control ATPase  32.62 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  34.6 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  32 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  37.04 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  36.61 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  33.5 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  33.63 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  38.17 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  35.15 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  34.19 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  33.48 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  34.15 
 
 		 280 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  34.38 
 
 		 336 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  33.48 
 
 		 316 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  37.57 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  33.93 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  31.98 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1750  C32 tRNA thiolase  33.48 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000779647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  33.93 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  33.93 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  32.71 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  32.89 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  32.89 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  31.98 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  32.89 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  33 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  33.93 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  37.57 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  32.89 
 
 		 331 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  33.48 
 
 		 311 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  33.48 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>