More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0233 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  100 
 
 		 269 aa  553  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1746  PP-loop family protein  59.18 
 
 		 345 aa  332  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0604543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1477  PP-loop family protein  59.18 
 
 		 345 aa  332  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170101  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0731  PP-loop domain protein  52.65 
 
 		 286 aa  294  9e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1698  PP-loop domain protein  55.3 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0182  PP-loop domain-containing protein  48.53 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  43.46 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  41.63 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  33.86 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  35.52 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  35.89 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  35.43 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  38.89 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  38.89 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  36.68 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  31.51 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  36.86 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  30.67 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  30.67 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  32.45 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  31.09 
 
 		 303 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  35.96 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  32.08 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  36.44 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  36.44 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  35.37 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  31.6 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  33.77 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  33.77 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  33.19 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  32.77 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  33.77 
 
 		 294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  34.73 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  34.73 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  31.02 
 
 		 314 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  31.87 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  31.43 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  34.65 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  31.6 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  34.21 
 
 		 315 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  31.95 
 
 		 289 aa  145  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  33.77 
 
 		 302 aa  145  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  33.77 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  33.77 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  33.77 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  33.77 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  34.06 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  32.89 
 
 		 247 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  30.61 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  31.47 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  33.88 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  29.8 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  32.79 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  35 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  31.28 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  30.56 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  33.19 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  30.74 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  32.51 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  30.74 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  30.74 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  32.64 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  30.74 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  30.74 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  30.37 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  30.37 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  32.24 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  30.37 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1405  C32 tRNA thiolase  33.77 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.237455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  32.92 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  32.1 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  32.89 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  30.37 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  33.47 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  33.47 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  33.47 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  31.84 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  31.6 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  30.28 
 
 		 323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  31.82 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  30.58 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  32.51 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1750  C32 tRNA thiolase  33.04 
 
 		 368 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000779647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  30.65 
 
 		 311 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  31.02 
 
 		 284 aa  138  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  30.65 
 
 		 311 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  30.65 
 
 		 311 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  30.65 
 
 		 311 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  30.65 
 
 		 311 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  32.02 
 
 		 235 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  34.31 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  34.31 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  30.33 
 
 		 311 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  31.69 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  30.24 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  30.58 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>