More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1746 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1746  PP-loop family protein  100 
 
 		 345 aa  708    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0604543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1477  PP-loop family protein  100 
 
 		 345 aa  708    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170101  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  59.18 
 
 		 269 aa  332  4e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0731  PP-loop domain protein  54.87 
 
 		 286 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1698  PP-loop domain protein  52.63 
 
 		 284 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0182  PP-loop domain-containing protein  48.72 
 
 		 288 aa  293  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  44.24 
 
 		 276 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  42.39 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  34.1 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  35.11 
 
 		 244 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  34.46 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  37.45 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  34.27 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  35.08 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  35.08 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  34.78 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  32.04 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  33 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  34.78 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  34.71 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  37.45 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  34.32 
 
 		 314 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  34.03 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  37.66 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  37.55 
 
 		 274 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  35.15 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  34.32 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  37.12 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  37.66 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  33.71 
 
 		 322 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  33.71 
 
 		 322 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  34.09 
 
 		 319 aa  149  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  33.71 
 
 		 322 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  34.23 
 
 		 310 aa  149  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  32.34 
 
 		 310 aa  149  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  33.71 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  33.71 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  36.65 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  33.47 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  36.52 
 
 		 274 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  33.77 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  30.34 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  32.17 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  35.74 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  30.34 
 
 		 291 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  36.09 
 
 		 274 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  30.68 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  32.86 
 
 		 279 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  32.95 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  32.95 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  32.95 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  34.11 
 
 		 311 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  34.09 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  33.47 
 
 		 237 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  32.28 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  32.77 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  32.32 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  33.09 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  33.21 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  31.51 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  31.43 
 
 		 282 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  33.74 
 
 		 260 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  33.19 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  33.19 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  31.31 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  30.95 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  31.31 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  35.8 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  35.8 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  35 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  32.77 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  31.49 
 
 		 289 aa  143  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1750  C32 tRNA thiolase  36.68 
 
 		 368 aa  142  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000779647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  32.35 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  32.35 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  32.77 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  33.98 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  33.98 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  34 
 
 		 264 aa  142  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  33.98 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  34.34 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  33.94 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  37.28 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  37.28 
 
 		 274 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  33.33 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  32.94 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  35.42 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  32.94 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  35.65 
 
 		 274 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  35.02 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  32.94 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  32.94 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  32.19 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  34.48 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  29.6 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  32.58 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  32.77 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>