More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2544 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  100 
 
 		 292 aa  597  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  52.63 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  53.97 
 
 		 290 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  55.93 
 
 		 294 aa  265  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  53.17 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  51.84 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  53.17 
 
 		 291 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  51.01 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  51.01 
 
 		 274 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  49.8 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  50.41 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  50 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  49.03 
 
 		 336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  50.61 
 
 		 284 aa  258  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  48.57 
 
 		 303 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  49.39 
 
 		 259 aa  258  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  53.81 
 
 		 298 aa  258  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  50.61 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  50.41 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  51.05 
 
 		 334 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  50.83 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  50 
 
 		 336 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  49.17 
 
 		 311 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  50.63 
 
 		 340 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  50.41 
 
 		 326 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  50.41 
 
 		 331 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  50.41 
 
 		 331 aa  254  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  50.41 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  48.37 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  47.77 
 
 		 274 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  47.77 
 
 		 274 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  49.39 
 
 		 313 aa  252  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  50 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  50 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  50 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  50 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  50 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  50 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  50 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  46.27 
 
 		 313 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  48.77 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  48.83 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  48.77 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  48.18 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  48.18 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  48.16 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  49.19 
 
 		 322 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  49.19 
 
 		 322 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  49.19 
 
 		 322 aa  249  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  46.97 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  48.18 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  49.59 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  47.45 
 
 		 338 aa  249  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  48.18 
 
 		 274 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  51.69 
 
 		 313 aa  248  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  50 
 
 		 289 aa  248  9e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  48.57 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  47.35 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  47.76 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  48.57 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  49.19 
 
 		 322 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  49.19 
 
 		 322 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  49.19 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  48.37 
 
 		 319 aa  246  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  49.19 
 
 		 310 aa  246  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  48.16 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  47.35 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  48.78 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  46.94 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  48.58 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  48.16 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  48.58 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  45.08 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  45.08 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  47.77 
 
 		 274 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  46.49 
 
 		 316 aa  244  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  47.77 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  46.94 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  46.94 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  46.94 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  46.94 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  46.94 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  46.94 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  48.57 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  46.94 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  46.94 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  47.41 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  45.08 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  45.08 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  45.08 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  48.16 
 
 		 310 aa  242  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  48.78 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  47.56 
 
 		 312 aa  242  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  48.31 
 
 		 305 aa  241  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  47.56 
 
 		 319 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  46.94 
 
 		 311 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1405  C32 tRNA thiolase  50.79 
 
 		 274 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.237455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  46.94 
 
 		 311 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  46.94 
 
 		 311 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  46.94 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>