More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2259 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 242 aa  502  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  52.54 
 
 		 237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  48.73 
 
 		 239 aa  259  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  52.21 
 
 		 235 aa  257  9e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  49.12 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  49.16 
 
 		 244 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  49.16 
 
 		 244 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  48.42 
 
 		 247 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  47.96 
 
 		 252 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  46.26 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  42.55 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  42.27 
 
 		 307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  45.45 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 		 282 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  38.53 
 
 		 259 aa  158  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  34.7 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  37.39 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  36.24 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0731  PP-loop domain protein  36 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  34.78 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  34.82 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  35 
 
 		 269 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  33.19 
 
 		 303 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  34.84 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  32.49 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  33.91 
 
 		 314 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  36.8 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  33.47 
 
 		 287 aa  135  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  31.51 
 
 		 291 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  31.51 
 
 		 291 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  37.39 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1698  PP-loop domain protein  35.53 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  34.25 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  35.14 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  35.14 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  32.91 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  32.17 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  32.91 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  34.19 
 
 		 307 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  32.61 
 
 		 315 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  36.44 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0125  PP-loop family protein  36 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.658918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  33.79 
 
 		 312 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  36.67 
 
 		 260 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  31.44 
 
 		 303 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  36 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  32.05 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1746  PP-loop family protein  33.77 
 
 		 345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0604543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1477  PP-loop family protein  33.77 
 
 		 345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170101  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  33.62 
 
 		 283 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  31.09 
 
 		 274 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  33.62 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0207  putative cell cycle control ATPase  36.16 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  31.2 
 
 		 274 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0182  PP-loop domain-containing protein  32.61 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  31.62 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  32.47 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  31.62 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  36.56 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  31.62 
 
 		 311 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  31.2 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  31.62 
 
 		 311 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1613  PP-loop domain-containing protein  32.11 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  32.48 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  31.2 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  31.2 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  31.91 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  31.2 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  31.09 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  31.91 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  31.47 
 
 		 336 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  31.88 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  30.57 
 
 		 313 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  31.08 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  32.48 
 
 		 322 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  32.48 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  32.48 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  31.1 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  32.48 
 
 		 322 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  32.48 
 
 		 322 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  31.62 
 
 		 316 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  31 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  32.05 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  31.62 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  31.47 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  32.05 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  30.04 
 
 		 274 aa  121  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2508  putative cell cycle control ATPase  36.02 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2223  PP-loop domain-containing protein  32.09 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  32.08 
 
 		 317 aa  121  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  30.3 
 
 		 309 aa  121  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  30.77 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 311 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  30.77 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  31.28 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 311 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  29.49 
 
 		 302 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>