More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0882 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  56.03 
 
 		 244 aa  278  7e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  49.58 
 
 		 252 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  47.32 
 
 		 247 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  44.16 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  41.45 
 
 		 237 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  40.17 
 
 		 244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  40.17 
 
 		 244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  39.01 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  44.02 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  38.46 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  42.27 
 
 		 242 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  36.67 
 
 		 260 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  37.84 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  38.4 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  38.26 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  37.25 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  36.84 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  36.72 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  36.72 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  36.72 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  36.72 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  36.72 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  36.72 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  36.72 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  36.84 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  36.72 
 
 		 331 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  39.56 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  34.93 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  34.77 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  40.08 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  34.8 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  36.44 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  36.44 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  35.55 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  36.29 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  36.03 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  35.55 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  35.55 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  37.34 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  38.39 
 
 		 316 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  35.74 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  35.74 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  37.9 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  33.11 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  36.03 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  35.15 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  36.14 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  35.89 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  35.89 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  35.89 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  35.89 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  35.89 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  31.95 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  35.89 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  35.89 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  36.44 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  36.03 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  35.04 
 
 		 312 aa  143  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  35.89 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  38.22 
 
 		 309 aa  143  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  34.7 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  42.93 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  36.03 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  36.03 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  33.22 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  37.25 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  37.71 
 
 		 252 aa  142  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  36.56 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  33.73 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  37.61 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  35.63 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  35.08 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  35.48 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  34.27 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  32.62 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0182  PP-loop domain-containing protein  31.28 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  37.5 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  35.08 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  35.08 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  35.08 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1746  PP-loop family protein  30.58 
 
 		 345 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0604543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1477  PP-loop family protein  30.58 
 
 		 345 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170101  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  39.06 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  34.8 
 
 		 338 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  35.08 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  35.08 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  35.08 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  35.08 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  35.08 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  34.4 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  34.47 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  34.07 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  36.93 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  32.18 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  36.93 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  35.71 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  34.4 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  30.89 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  30.89 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>