More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1321 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 252 aa  523  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  49.59 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  49.58 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  51.74 
 
 		 237 aa  234  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  47.9 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  48.54 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  48.54 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  47.11 
 
 		 239 aa  222  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  46.7 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  45.23 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  47.96 
 
 		 242 aa  211  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  42.17 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  37.25 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  38.1 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  39.13 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  36.61 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  36.4 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0125  PP-loop family protein  36.4 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.658918  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  36.08 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  33.61 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  34.94 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  33.89 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  35.71 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  34.87 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  37.86 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  37.86 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  35.78 
 
 		 282 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  35.17 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  35.17 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  35.17 
 
 		 322 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1749  PP-loop family protein  33.33 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.10614  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  35.29 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  35.17 
 
 		 322 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  35.17 
 
 		 322 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1405  C32 tRNA thiolase  35.83 
 
 		 274 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.237455 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  33.99 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  32.94 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  34.02 
 
 		 315 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  35.04 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  35.27 
 
 		 311 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  33.2 
 
 		 274 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  36.32 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  32.92 
 
 		 303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  33.9 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  34.02 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  33.2 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  33.2 
 
 		 312 aa  138  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  35.95 
 
 		 336 aa  138  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  34.32 
 
 		 319 aa  138  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  33.2 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  33.2 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  35.15 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  35.12 
 
 		 336 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  33.2 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  32.53 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  34.3 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  35.12 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  34.3 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  31.67 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  34.3 
 
 		 331 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  35.68 
 
 		 338 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  34.75 
 
 		 322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  34.75 
 
 		 322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  31.67 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  34.75 
 
 		 322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0731  PP-loop domain protein  35.9 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  33.33 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  33.73 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  33.72 
 
 		 283 aa  135  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  32.08 
 
 		 290 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  33.74 
 
 		 284 aa  135  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 319 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  34.57 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  34.71 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0527  PP-loop domain protein  33.19 
 
 		 250 aa  135  8e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 283 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1835  ATPase  35.04 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  33.88 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  33.76 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  33.88 
 
 		 326 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  34.3 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  34.01 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  33.88 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  34.01 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  32.39 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  32.79 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  33.88 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  33.88 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  35 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  33.6 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  32.78 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>