More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0527 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0527  PP-loop domain protein  100 
 
 		 250 aa  522  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  64.61 
 
 		 252 aa  345  5e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1749  PP-loop family protein  64.2 
 
 		 256 aa  345  6e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.10614  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  63.67 
 
 		 250 aa  340  9e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  62.14 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  58.94 
 
 		 253 aa  319  3e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  57.6 
 
 		 251 aa  311  4.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  57.2 
 
 		 251 aa  311  6.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0125  PP-loop family protein  56.8 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.658918  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  59.34 
 
 		 243 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  43.75 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  43.75 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  40 
 
 		 264 aa  164  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  42.91 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  38.84 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  36.99 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  41.1 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  36.78 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  35.77 
 
 		 274 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0182  PP-loop  40.85 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  35.2 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  34.68 
 
 		 283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  35.37 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  34.68 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  35.37 
 
 		 274 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  35.77 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  35.37 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  35.08 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  35.37 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  35.25 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  34.3 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  34.3 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0207  putative cell cycle control ATPase  42.39 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  33.47 
 
 		 274 aa  148  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  34.84 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  34.82 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  35.06 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  34.84 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  34.55 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  36.97 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  35.04 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  35.81 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  34.43 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  36 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  34.27 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  33.61 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  33.61 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  34.52 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 311 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  34.15 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  31.15 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 311 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 311 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 311 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10299  predicted protein  43.43 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  32.79 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  33.06 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  33.06 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  36 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  33.06 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  31.15 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  33.61 
 
 		 284 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  33.47 
 
 		 303 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2508  putative cell cycle control ATPase  40.66 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  34 
 
 		 322 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  34 
 
 		 322 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  34.4 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  34 
 
 		 322 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  33.87 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  33.88 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  34 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  34 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  33.88 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  33.33 
 
 		 297 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 319 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  32.53 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  33.47 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  34.4 
 
 		 322 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  34.4 
 
 		 322 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  34.4 
 
 		 322 aa  138  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  34.02 
 
 		 309 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  32.93 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  34.27 
 
 		 294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  34.94 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 289 aa  135  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  34.02 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  34.45 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  31.58 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>