More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1130 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  100 
 
 		 256 aa  520  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  59.67 
 
 		 280 aa  308  5.9999999999999995e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0207  putative cell cycle control ATPase  62.34 
 
 		 265 aa  295  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  58.9 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0182  PP-loop  54.94 
 
 		 279 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2508  putative cell cycle control ATPase  59.21 
 
 		 251 aa  269  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_4708  predicted protein  52.15 
 
 		 220 aa  232  5e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10299  predicted protein  55.84 
 
 		 199 aa  228  8e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  40.65 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  41.95 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  43.21 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  43.21 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1749  PP-loop family protein  41.35 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.10614  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  41.67 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0125  PP-loop family protein  42.8 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.658918  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  40.93 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  36.91 
 
 		 307 aa  171  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  42.73 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  41.77 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  39.24 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0527  PP-loop domain protein  43.75 
 
 		 250 aa  168  7e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 311 aa  168  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 311 aa  168  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 311 aa  168  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 311 aa  168  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 311 aa  168  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  39.34 
 
 		 311 aa  168  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  39.34 
 
 		 311 aa  168  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 311 aa  168  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  37.77 
 
 		 313 aa  168  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  38.86 
 
 		 274 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  40.28 
 
 		 313 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  39.81 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  40.09 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  36.36 
 
 		 315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  38.36 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  38.43 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  40.73 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  37.79 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  35.81 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  36.51 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  36.36 
 
 		 312 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  39.62 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  39.62 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  39.62 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  38.86 
 
 		 311 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  37.66 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  36.68 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  37.23 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  37.99 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  35.68 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  37.28 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  36.8 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  36.8 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  36.07 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  39.75 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  36.21 
 
 		 310 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  35.81 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  36.24 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  36.8 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  39.73 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0863  C32 tRNA thiolase  38.39 
 
 		 314 aa  156  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  38.94 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  38.94 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  37.23 
 
 		 298 aa  155  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  36.36 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  37.56 
 
 		 322 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  37.56 
 
 		 322 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  37.56 
 
 		 322 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  35.48 
 
 		 312 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  37.12 
 
 		 302 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  34.88 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  35.81 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  35.71 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  35.81 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  35.93 
 
 		 336 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  33.06 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  35.37 
 
 		 336 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  34.55 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  36.97 
 
 		 310 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  35.81 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  35.55 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  36.68 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 312 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  35.81 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  39.21 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  34.06 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  35.06 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  33.33 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  35.81 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  35.5 
 
 		 331 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>