288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_4708 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_4708  predicted protein  100 
 
 		 220 aa  458  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  52.15 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  52.15 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0207  putative cell cycle control ATPase  52.58 
 
 		 265 aa  231  9e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10299  predicted protein  52.74 
 
 		 199 aa  228  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127345  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  49.52 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0182  PP-loop  48.4 
 
 		 279 aa  221  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2508  putative cell cycle control ATPase  50 
 
 		 251 aa  205  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  47.34 
 
 		 269 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  43.35 
 
 		 251 aa  151  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  42.86 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0125  PP-loop family protein  42.36 
 
 		 253 aa  148  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.658918  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  40 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  36.65 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  33.99 
 
 		 319 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  32.55 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  37.17 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  34.48 
 
 		 310 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  36.65 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  36.13 
 
 		 274 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  35.6 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  35.6 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  35.6 
 
 		 274 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  35.6 
 
 		 274 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_4674  predicted protein  33.33 
 
 		 252 aa  138  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.594652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  34.62 
 
 		 282 aa  138  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  39.9 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  33.5 
 
 		 310 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  33.5 
 
 		 322 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  33.5 
 
 		 322 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  33.5 
 
 		 322 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  35.96 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  38.92 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  37.44 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  35.08 
 
 		 274 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  35.08 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  36.56 
 
 		 311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  35.47 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  34.45 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  33.5 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  32.04 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  38.92 
 
 		 253 aa  135  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  35.08 
 
 		 274 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1749  PP-loop family protein  38.92 
 
 		 256 aa  135  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.10614  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  34.65 
 
 		 294 aa  135  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  33.5 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  31.98 
 
 		 292 aa  135  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  33.5 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  34.03 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  34.03 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  33.02 
 
 		 307 aa  134  9e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  33 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  33 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  32.69 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  32.67 
 
 		 284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  33 
 
 		 322 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  35.08 
 
 		 319 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  33 
 
 		 310 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  33.17 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  33 
 
 		 310 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  35.48 
 
 		 312 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  35.38 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  33.5 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  34.63 
 
 		 302 aa  131  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  34.48 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  33.17 
 
 		 310 aa  131  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  32.71 
 
 		 311 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  35.6 
 
 		 316 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  32.67 
 
 		 311 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  35.08 
 
 		 318 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  34.74 
 
 		 258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  32.24 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  33.5 
 
 		 289 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  32.24 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  32.18 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  32.24 
 
 		 311 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  35.78 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  32.24 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  32.24 
 
 		 311 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  33 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  32.24 
 
 		 311 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  34.47 
 
 		 314 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  32.24 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  32.24 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  32.24 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  32.24 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  32.24 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  32.24 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  32.24 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  31.68 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  32.24 
 
 		 311 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  32.51 
 
 		 313 aa  128  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  31.53 
 
 		 237 aa  128  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  35.52 
 
 		 264 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  32.71 
 
 		 313 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  32.71 
 
 		 313 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  32.71 
 
 		 313 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  30.24 
 
 		 290 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  32.68 
 
 		 340 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  29.27 
 
 		 291 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>