More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_4674 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_4674  predicted protein  100 
 
 		 252 aa  523  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.594652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  50.62 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  45.2 
 
 		 336 aa  241  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  46.4 
 
 		 302 aa  240  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  45.2 
 
 		 336 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  45.6 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  45.6 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  45.6 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  45.6 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  46.4 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  45.6 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  45.6 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  45.6 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  47.72 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  46.96 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  45.6 
 
 		 331 aa  238  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  47.76 
 
 		 289 aa  238  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  45.2 
 
 		 317 aa  238  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  45.49 
 
 		 331 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  46 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  44.58 
 
 		 314 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  46.03 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  46.31 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  45.63 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  45.63 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  44.44 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  45.49 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  45.63 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  45.97 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  45.49 
 
 		 331 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  45.2 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  44.84 
 
 		 311 aa  235  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  45.49 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  45.31 
 
 		 317 aa  235  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  45.63 
 
 		 311 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  45.63 
 
 		 311 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  44.05 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  45.08 
 
 		 331 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  45.24 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  45.6 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  45.93 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  43.03 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  45.24 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  45.24 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  45.24 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  45.24 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  45.24 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  46.56 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  43.87 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  43.87 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  44.86 
 
 		 340 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  46.28 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  45.24 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  45.24 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  45.24 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  45.24 
 
 		 311 aa  232  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  45.53 
 
 		 290 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  44.86 
 
 		 334 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  45.31 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  47.56 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  45.71 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  45.71 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  45.71 
 
 		 322 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  45.31 
 
 		 322 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  43.87 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  45.53 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  45.31 
 
 		 322 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  44.9 
 
 		 310 aa  229  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  45.12 
 
 		 291 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  45.08 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  45.12 
 
 		 291 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  45.78 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  44.05 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  44.72 
 
 		 313 aa  229  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  44.22 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  44.8 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  44.49 
 
 		 322 aa  228  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  44.49 
 
 		 322 aa  228  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  44.49 
 
 		 322 aa  228  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  44.05 
 
 		 279 aa  228  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  45.38 
 
 		 274 aa  228  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  43.6 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  44.08 
 
 		 310 aa  227  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1405  C32 tRNA thiolase  47.54 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.237455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  44 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  45.49 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  45.08 
 
 		 297 aa  227  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  43.65 
 
 		 323 aa  227  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  45.49 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  43.6 
 
 		 299 aa  227  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  45.49 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  44.49 
 
 		 311 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  42.21 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  42.21 
 
 		 256 aa  225  4e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  43.15 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  42.51 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  44.53 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  43.15 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  42.56 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0863  C32 tRNA thiolase  45.38 
 
 		 314 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>