More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3405 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  100 
 
 		 239 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  72.15 
 
 		 237 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  55.74 
 
 		 235 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  52.19 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  48.73 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  50.64 
 
 		 244 aa  255  5e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  50.64 
 
 		 244 aa  255  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  45.15 
 
 		 247 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  47.11 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  46.38 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  38.46 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  41.79 
 
 		 244 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  39.92 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  39.09 
 
 		 247 aa  168  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  39.39 
 
 		 282 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  38.86 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  38.86 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  39.09 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  37.99 
 
 		 312 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  38.79 
 
 		 313 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  37.9 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  38.26 
 
 		 311 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  38.26 
 
 		 311 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  38.26 
 
 		 311 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  38.26 
 
 		 311 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  38.26 
 
 		 311 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  38.26 
 
 		 311 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  38.26 
 
 		 311 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  39.37 
 
 		 311 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  40.91 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  38.26 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  38.96 
 
 		 311 aa  151  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  42.64 
 
 		 313 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  37.83 
 
 		 311 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  35.84 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  37.83 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  37.78 
 
 		 303 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  37.39 
 
 		 313 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  36.36 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  36.36 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  37.12 
 
 		 303 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  37.39 
 
 		 311 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  37.39 
 
 		 311 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  37.39 
 
 		 311 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  37.39 
 
 		 311 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  37.39 
 
 		 311 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  36.24 
 
 		 312 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  39.13 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  35.93 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  36.94 
 
 		 314 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  35.04 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  41.62 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  41.01 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  41.62 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  35.93 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  35.5 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  34.62 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  38.6 
 
 		 287 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  36.6 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  37.66 
 
 		 310 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  35.5 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  36.6 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  35.93 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  38.53 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  38.53 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  38.53 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  34.93 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  38.5 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  34.93 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  35.37 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  37.05 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  36.09 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  36.8 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  36.8 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  34.62 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  33.47 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0182  PP-loop  35.56 
 
 		 279 aa  142  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  36.8 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1698  PP-loop domain protein  39.32 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  39.34 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  37.33 
 
 		 302 aa  142  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  33.19 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  37.07 
 
 		 331 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  35.19 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  35.81 
 
 		 284 aa  141  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  38.26 
 
 		 331 aa  141  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  36.84 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  38.33 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0182  PP-loop domain-containing protein  33.76 
 
 		 288 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  34.76 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  37.83 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  37.83 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  37.39 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  37.83 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  37.83 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  35.98 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  37.83 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  37.83 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  36.64 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  37.83 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>