More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04150 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  100 
 
 
363 aa  756    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  57.1 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  65.57 
 
 
422 aa  391  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  33.66 
 
 
311 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  35.71 
 
 
300 aa  170  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  32.01 
 
 
302 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  33.23 
 
 
319 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  33.12 
 
 
326 aa  162  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  32.9 
 
 
308 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  32.9 
 
 
308 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  33.99 
 
 
315 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  32.67 
 
 
308 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  32.08 
 
 
319 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  30.99 
 
 
304 aa  156  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  34.67 
 
 
326 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  31.96 
 
 
311 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  31.03 
 
 
323 aa  153  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  31.93 
 
 
332 aa  153  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  32.32 
 
 
330 aa  153  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  31.15 
 
 
337 aa  150  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  30.56 
 
 
329 aa  150  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  31.62 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  30.33 
 
 
332 aa  145  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  32.87 
 
 
343 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  32.27 
 
 
309 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  31.29 
 
 
327 aa  143  4e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  31.72 
 
 
315 aa  143  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  29.47 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  36.02 
 
 
304 aa  139  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  31.27 
 
 
311 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  31.29 
 
 
321 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  30.06 
 
 
318 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  28.99 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  28.28 
 
 
300 aa  116  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  29.47 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  27.21 
 
 
304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  26.4 
 
 
323 aa  113  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  28.43 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  26.89 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  28.9 
 
 
304 aa  109  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  25.24 
 
 
301 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  28.48 
 
 
297 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  24.14 
 
 
323 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  25.16 
 
 
299 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  26.76 
 
 
307 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  28.34 
 
 
303 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  28 
 
 
312 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  26.3 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  25.09 
 
 
288 aa  92.8  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  26.8 
 
 
302 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  27.6 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 
303 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  26.06 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  23.93 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  29.09 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  23.93 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  26.51 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  26.05 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  24.55 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  26.83 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  25.66 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  29.69 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  29.69 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  27.52 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  25.36 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  26.18 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  27.91 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  23.79 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  28.16 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  28.16 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  29.38 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1698  PP-loop domain protein  25.66 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  24.59 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  24.43 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  23.91 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  28.81 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  28.19 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  26.67 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  25.61 
 
 
315 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  25.22 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  24.09 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  26.75 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  25.61 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  24.77 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  25.22 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  29.07 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  25.66 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  25.66 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  25.66 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  29.25 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  23.56 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  23.56 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  23.56 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  26.43 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>