297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1317 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 
311 aa  631  1e-180  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  93.57 
 
 
311 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  93.89 
 
 
311 aa  598  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  71.43 
 
 
308 aa  477  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  71.43 
 
 
308 aa  477  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  60.73 
 
 
311 aa  392  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  37.54 
 
 
302 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  35.83 
 
 
319 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  38.41 
 
 
302 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  37.34 
 
 
326 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  33.03 
 
 
326 aa  206  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  33.44 
 
 
319 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  34.78 
 
 
321 aa  203  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  33.13 
 
 
332 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  32.78 
 
 
308 aa  190  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  35.65 
 
 
315 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  32.34 
 
 
304 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  36.54 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  31.99 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  33.23 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  32.79 
 
 
315 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  32.89 
 
 
300 aa  166  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  33.12 
 
 
330 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  31.95 
 
 
332 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  32.82 
 
 
337 aa  159  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  30.92 
 
 
328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  34.38 
 
 
343 aa  155  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  32.48 
 
 
327 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  31.27 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  29.62 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  31.89 
 
 
297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  30.42 
 
 
300 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  29.87 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  32.97 
 
 
422 aa  132  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  27.88 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  27.36 
 
 
297 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  27.04 
 
 
376 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  28.62 
 
 
323 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  28.48 
 
 
318 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  30.74 
 
 
304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  27.78 
 
 
311 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  29.28 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  26.64 
 
 
310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  29.13 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  25.58 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  27.96 
 
 
303 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  27.36 
 
 
304 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  28.52 
 
 
287 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  27.92 
 
 
304 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  27.06 
 
 
303 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  25.5 
 
 
288 aa  103  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  26.62 
 
 
323 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  26.25 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  30.38 
 
 
235 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  28.19 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  28.19 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  29.34 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  24.76 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0175  PP-loop domain-containing protein  29.1 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0125  PP-loop family protein  30.93 
 
 
253 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.658918  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  26.64 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  26.02 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  30.93 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  26.73 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  26.25 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  26.34 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  26.34 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  30.08 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  26.69 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  27.27 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2223  PP-loop domain-containing protein  28.82 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1613  PP-loop domain-containing protein  26.78 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  25 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  25.52 
 
 
247 aa  77  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  26.77 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  27.06 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  20.88 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  27.73 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  26.45 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  30.46 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  25.47 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1749  PP-loop family protein  26.26 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.10614  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  31.25 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  31.25 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  28.8 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  31.25 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  27.89 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1080  PP-loop domain protein  26.41 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  0.20171 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  28.02 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  25.74 
 
 
269 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0147  PP-loop domain-containing protein  23.79 
 
 
248 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  34.27 
 
 
243 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1512  C32 tRNA thiolase  26.75 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.8984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  26.46 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  24.78 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2154  C32 tRNA thiolase  27.98 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  26.17 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1945  C32 tRNA thiolase  28.4 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104591  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  27.16 
 
 
269 aa  67  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0244  hypothetical protein  27.46 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>