103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2322 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  43.66 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  31.33 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  29.87 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  28.57 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  26.4 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  30.03 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1195  PP-loop domain-containing protein  34.35 
 
 		 259 aa  105  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  25.16 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  25.64 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  25.86 
 
 		 319 aa  85.5  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  21.57 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  28.2 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  25.55 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  27.3 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  22.52 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  24.46 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  25.88 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  21.55 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  20.88 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  21.05 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  21.05 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  23.49 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  20.81 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  23.47 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  24.68 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  26.82 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  28.49 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  25.17 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2602  hypothetical protein  24.34 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  24.52 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  20.07 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  23.32 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  28.02 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  26.51 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  24.42 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  29.15 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  21.32 
 
 		 509 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  24.51 
 
 		 376 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  23.2 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  24.06 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  25.51 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  25 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  23.23 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  28.25 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.57 
 
 		 485 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000793902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.31 
 
 		 471 aa  49.7  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  22.41 
 
 		 313 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  18.07 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  22.68 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1352  hypothetical protein  36.96 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000857544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  24.27 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1080  PP-loop domain protein  24.04 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  0.20171 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  28.57 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  26.15 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  24 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  23.89 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  25 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  23.91 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  20.25 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  27.32 
 
 		 302 aa  45.8  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  22.65 
 
 		 302 aa  45.8  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  24.43 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  28.26 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0309  C32 tRNA thiolase  25.73 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  26.6 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  26.6 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  24.43 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  22 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  27.91 
 
 		 464 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  22.92 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  22.92 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.15 
 
 		 470 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  21.23 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  21.67 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  22.92 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  24.62 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  23.39 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  23.87 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  24.17 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  23.33 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  23.21 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  23.17 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  23.53 
 
 		 336 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  24.43 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  24.43 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  21.58 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  21.4 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  23.75 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  23.75 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  23.75 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  23.75 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  23.75 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  23.75 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  23.75 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  23.42 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  17.65 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0101  C32 tRNA thiolase  23.44 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  21.58 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  23.75 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>