More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0991 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  618  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  69.21 
 
 
302 aa  455  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  51.01 
 
 
326 aa  315  8e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  48.6 
 
 
343 aa  285  8e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  44.78 
 
 
308 aa  263  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  42.54 
 
 
319 aa  262  4.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  45.61 
 
 
304 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  41.56 
 
 
326 aa  249  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  41.27 
 
 
319 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  42.64 
 
 
332 aa  247  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  41.14 
 
 
321 aa  237  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  41.84 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  41.58 
 
 
300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  41.67 
 
 
328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  36.79 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  38.41 
 
 
311 aa  208  7e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  38.41 
 
 
311 aa  208  9e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  36.54 
 
 
308 aa  207  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  36.54 
 
 
308 aa  207  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  36.42 
 
 
311 aa  207  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  39.87 
 
 
323 aa  202  6e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  38.41 
 
 
311 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  37.95 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  37.26 
 
 
332 aa  190  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  35.92 
 
 
315 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  37.1 
 
 
329 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  36.77 
 
 
330 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  35.67 
 
 
327 aa  176  4e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  33.65 
 
 
337 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  32.01 
 
 
363 aa  168  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  34.9 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  33.66 
 
 
318 aa  162  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  33.22 
 
 
318 aa  162  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  33 
 
 
323 aa  161  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  33.7 
 
 
422 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  31.88 
 
 
300 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  33.33 
 
 
323 aa  152  8e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  30.67 
 
 
301 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  33.44 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  33.44 
 
 
304 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  34.25 
 
 
376 aa  144  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  31.33 
 
 
298 aa  143  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  30.67 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  29.57 
 
 
288 aa  138  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  30.43 
 
 
297 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  30.67 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  28.09 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  28.52 
 
 
299 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  27 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  28 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  33.7 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  28 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  28.48 
 
 
312 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  27.04 
 
 
303 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  33.77 
 
 
282 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  27.12 
 
 
310 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  28.71 
 
 
303 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1195  PP-loop domain-containing protein  29.67 
 
 
259 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  36 
 
 
274 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  35.71 
 
 
274 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  32.51 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  34.68 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  34.23 
 
 
274 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  33.19 
 
 
274 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  33.77 
 
 
264 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  31.51 
 
 
317 aa  93.2  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  33.78 
 
 
274 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  31.51 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  33.04 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  31.88 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  32.31 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  30.25 
 
 
326 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  31.86 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  30.25 
 
 
331 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  30.25 
 
 
331 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  32.09 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  34.54 
 
 
259 aa  89.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  31.82 
 
 
323 aa  89.4  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  30.7 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  29.83 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  30.26 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  31.86 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  26.98 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  30.71 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  30.67 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  30.5 
 
 
310 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  30.5 
 
 
310 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  32 
 
 
316 aa  87  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  30.5 
 
 
322 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  29.83 
 
 
313 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  30.5 
 
 
322 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  30.5 
 
 
322 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  27.41 
 
 
340 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  30.54 
 
 
309 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  27.52 
 
 
334 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  30.63 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  29.01 
 
 
331 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0772  C32 tRNA thiolase  31.97 
 
 
381 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.26194  normal  0.702409 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  29.01 
 
 
331 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  29.01 
 
 
331 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>