More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2212 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  642    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  40.07 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  38.51 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  40.55 
 
 		 315 aa  202  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  37.95 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  36.45 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  35.91 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  33.65 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  33.65 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  33.55 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  33.55 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  31.56 
 
 		 326 aa  172  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  36.21 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  33.76 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  35.88 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  33.99 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  33.88 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  36.54 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  35.88 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  30.67 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  31.41 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  29.7 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  35.94 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  35.16 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  32.27 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  32.78 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  33.21 
 
 		 422 aa  142  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  31.1 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  32.4 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  30.62 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  30.56 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  30.86 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  29.02 
 
 		 318 aa  125  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  29.97 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  30.06 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  27.12 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  26.56 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  26.91 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  27.72 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  27.6 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  25.25 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  25.25 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  25.25 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  25.66 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  25.74 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  25.08 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  26.33 
 
 		 301 aa  92.4  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  24.49 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  25.59 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  25.17 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  24.25 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  25.58 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  25.75 
 
 		 303 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  29.41 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  22.34 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  29.91 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  29.82 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  29.41 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  28.81 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  29.82 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  30.58 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  29.82 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0175  PP-loop domain-containing protein  29.35 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  29.39 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  29.39 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  29.02 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  29.41 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  29.15 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  25.68 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  26.7 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  26.34 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  27.11 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  29.58 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  27.56 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  26.47 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  29.41 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  29.41 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  29.41 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  28.7 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  28.91 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0309  C32 tRNA thiolase  35.07 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  28.91 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  26.29 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  26.29 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  28.92 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  27.4 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1080  PP-loop domain protein  30.35 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  0.20171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0058  C32 tRNA thiolase  30.52 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0330  C32 tRNA thiolase  29.19 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  32.26 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  27.96 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  27.96 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  32.26 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  27.96 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  29.06 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  28.77 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  27.49 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  27.54 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  25.21 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>