278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0727 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  99.34 
 
 		 304 aa  620  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  51.16 
 
 		 323 aa  314  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  47.8 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  46.41 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  46.42 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  43.2 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  38.67 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  40.27 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  38.03 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  39.4 
 
 		 302 aa  215  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  37.29 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  39.29 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  36.93 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  37.5 
 
 		 303 aa  193  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  36 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  35.23 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  37.42 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  34.46 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  36.61 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  35.92 
 
 		 318 aa  175  9e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  34.31 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  33.99 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  31.89 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  32.45 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  33.44 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  31.51 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  30.28 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  32.97 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  31.13 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  28.11 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  31.83 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  29.69 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  28.48 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  27.83 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  29.15 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  29.35 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  30.8 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  31.4 
 
 		 422 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  29.07 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  29.35 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  28.1 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  27.16 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  27.21 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  28.8 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  31.05 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  27.69 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  24.85 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  27.36 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  27.18 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  30.45 
 
 		 343 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  33.12 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  25.25 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  26.86 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  26.86 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  27.04 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  28.14 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  30.04 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  25.39 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  26.92 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  26.83 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  25.97 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  25.68 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  26.46 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  28.83 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  24.64 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  24.29 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  25.21 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  26.61 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  23.55 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1746  PP-loop family protein  27.11 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0604543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1477  PP-loop family protein  27.11 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170101  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  23.19 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  25.54 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  30.67 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  27.73 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  30.67 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  24.77 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  25.11 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  26.01 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  24.77 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  29.26 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  23.77 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  25.22 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  28.76 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  28.29 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  25.55 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  26.16 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  26.77 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  26.01 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  23.53 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  24.15 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  24.89 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  24.89 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  26.01 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  24.47 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  24.15 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  25.11 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  24.47 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  23.4 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>