More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0170 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  100 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  70.99 
 
 		 297 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  57.09 
 
 		 297 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  43.54 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  39.07 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  40.89 
 
 		 312 aa  225  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  41.61 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  41.69 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  36.84 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  38.91 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  37.04 
 
 		 301 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  38.08 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  40.54 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  40.54 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  35.37 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  36.67 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  34.09 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  34.2 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  35.76 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  35.67 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  35.14 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  31.51 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  30.55 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  33.55 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  29.84 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  32.2 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  28.43 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  28.43 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  29.53 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  28.57 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  29.22 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  27.85 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  28.09 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  30.1 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  27.42 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  29.24 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  30.58 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  27.12 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  29.36 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  28.66 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  28.86 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  27.71 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  30.15 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  29.27 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  28.8 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  26.03 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  30.27 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  28.47 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  30.86 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  28.18 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  27.87 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  28.86 
 
 		 422 aa  102  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  30.74 
 
 		 327 aa  102  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  29.43 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  27.42 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  27.04 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  25 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  28.63 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  27.08 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  25.11 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  25.91 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  25.94 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  26.09 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  32.45 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  22.27 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  26.29 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  26.03 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  22.75 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  25.97 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  24.79 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  25.11 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  23.65 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2223  PP-loop domain-containing protein  29.81 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  20.41 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  20.41 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0175  PP-loop domain-containing protein  22.56 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  25.83 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1405  C32 tRNA thiolase  25.1 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.237455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1698  PP-loop domain protein  25.62 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  27 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  27 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  26.53 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  27.39 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  22.59 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0527  PP-loop domain protein  26.97 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  22.97 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  30.2 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  23.72 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  23.28 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  30.36 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  24.89 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  25.53 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1746  PP-loop family protein  23.61 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0604543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1477  PP-loop family protein  23.61 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170101  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  25.53 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0125  PP-loop family protein  26.69 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.658918  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  25.53 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0454  hypothetical protein  27.08 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0339442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  25.96 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  26.09 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>