More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0175 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  100 
 
 		 332 aa  672    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  73.11 
 
 		 321 aa  477  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  69.46 
 
 		 326 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  70.52 
 
 		 319 aa  457  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  68.69 
 
 		 319 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  42.64 
 
 		 302 aa  256  6e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  41.1 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  39.39 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  33.13 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  33.13 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  33.13 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  33.43 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  31.83 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  32.92 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  33.13 
 
 		 311 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  34.85 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  33.65 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  33.84 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  33.54 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  30.67 
 
 		 309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  28.1 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  32.84 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  33.54 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  31.94 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  32.53 
 
 		 363 aa  155  6e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  31.85 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  31.65 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  32.92 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  30.86 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  30.75 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  31.45 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  30.56 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  29.85 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  28.53 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  28.49 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  25.15 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  26.3 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  24.69 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  25.76 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  28.7 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  25.15 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  27.49 
 
 		 299 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  28.44 
 
 		 307 aa  109  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  27.27 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  25.89 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  25.85 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  25.69 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  24.18 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  26.47 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  25.3 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  27.27 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  25.79 
 
 		 302 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  26.82 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  27.85 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  26.82 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  24.07 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0175  PP-loop domain-containing protein  23.81 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  27.92 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  27.9 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  28.07 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  24.82 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  27.5 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  26.44 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  26.67 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  23.32 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  26.05 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  26.67 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0330  C32 tRNA thiolase  25.94 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  26.46 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  25.8 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  25.77 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  24.93 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  26.49 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  27.71 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  26.32 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  25.44 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  30.68 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  27.27 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  26.05 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  25.38 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  24.9 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  27.56 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  27.56 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  26.61 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  25.95 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  24.44 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  25.95 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  24.44 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  25.54 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  23.64 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  24.44 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  25.67 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  23.51 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  22.88 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  24.44 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  24.44 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1195  PP-loop domain-containing protein  27.3 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  25.62 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  25.97 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0772  C32 tRNA thiolase  26.28 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.26194  normal  0.702409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>