More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1144 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  100 
 
 
308 aa  633  1e-180  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  44.78 
 
 
302 aa  263  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  44.11 
 
 
302 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  41.75 
 
 
326 aa  242  5e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  35.99 
 
 
319 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  34.9 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  34.9 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  34.39 
 
 
319 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  33.55 
 
 
321 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  33.11 
 
 
311 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  32.6 
 
 
326 aa  189  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  33.44 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  32.89 
 
 
311 aa  188  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  36.97 
 
 
343 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  32.92 
 
 
332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  38.01 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  36 
 
 
328 aa  180  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  32.78 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  35.23 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  30.23 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  34.38 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  33.22 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  32.69 
 
 
323 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  33.01 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  34.42 
 
 
315 aa  166  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  34.31 
 
 
304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  34.31 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  34.01 
 
 
318 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  33.22 
 
 
300 aa  160  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  32.91 
 
 
304 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  33.66 
 
 
329 aa  159  7e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  32.47 
 
 
332 aa  158  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  32.67 
 
 
363 aa  157  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  32.33 
 
 
300 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  32.67 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  32.36 
 
 
327 aa  153  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  30.13 
 
 
323 aa  152  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  30.07 
 
 
330 aa  151  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  30.98 
 
 
307 aa  149  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  33.99 
 
 
287 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  30 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  29.84 
 
 
297 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  32.78 
 
 
309 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  29.8 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  29.9 
 
 
313 aa  138  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  31.37 
 
 
312 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  29.14 
 
 
301 aa  135  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  31.34 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  28.39 
 
 
376 aa  131  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  29.9 
 
 
311 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  30.23 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  29.47 
 
 
302 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  29.64 
 
 
303 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  29.29 
 
 
310 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  26.4 
 
 
298 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  26.77 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  29.97 
 
 
282 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  27.89 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  28.44 
 
 
252 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  26.78 
 
 
235 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  27.43 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  29.92 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  30.45 
 
 
260 aa  79  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  30.09 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  29.44 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0831  C32 tRNA thiolase  28.7 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0824  hypothetical protein  28.7 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.954938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  30.37 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  28.63 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0175  PP-loop domain-containing protein  25.9 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  27.23 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  27.23 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  29.44 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1613  PP-loop domain-containing protein  29.37 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  26.74 
 
 
307 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0182  PP-loop  31.36 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  30.46 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  27.75 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  30.2 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1195  PP-loop domain-containing protein  23.48 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  29.84 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  27.3 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  27.21 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  31.14 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  25.63 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  27.43 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  28.64 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  29.3 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  28.64 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  28.64 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  27.43 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  28.24 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1512  C32 tRNA thiolase  27.27 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.8984 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  30.26 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  29.88 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  26.87 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  28.64 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  25.63 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  27.43 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1749  PP-loop family protein  35.06 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.10614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>