281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1938 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 315 aa  647    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  65.5 
 
 		 323 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  35.35 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  35.92 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  35.65 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  36.68 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  34.73 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  33.66 
 
 		 302 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  33.01 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  33.01 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  35.53 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  35.65 
 
 		 311 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  33.03 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  34.42 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  36.27 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  32.81 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  32.92 
 
 		 327 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  33.54 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  32.6 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  33.43 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  34.43 
 
 		 300 aa  159  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  31.94 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  32.63 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  35.62 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  32.29 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  32.19 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  35.94 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  30.62 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  31.72 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  33.67 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  31.63 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  32.57 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  31.75 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  34.06 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  31.67 
 
 		 422 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  29.38 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  29.02 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  32.28 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  30.22 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  33.02 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  30.23 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  31.37 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  30.45 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  32.82 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  31.05 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  32.14 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  27.62 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  29.75 
 
 		 313 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  27.45 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  29.22 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  30.27 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  28.66 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  26.47 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  27.6 
 
 		 288 aa  92.4  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  27.76 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  27.65 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  26.55 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  29.63 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  26.07 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  26.07 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  27.98 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  27.78 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  27.98 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  27.31 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  27.52 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  28.18 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  27.78 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  24.83 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  24.42 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  22.05 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  27.93 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  24.07 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  27.27 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  24.62 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  25.91 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  22.05 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  22.05 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  27.27 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  25 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  21.86 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  26.23 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  26.12 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  22.92 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  25.69 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  22.87 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  25.62 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  25.62 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0207  putative cell cycle control ATPase  23.02 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  26.15 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0330  C32 tRNA thiolase  26.5 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  25.57 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  26.79 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  25.2 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  24.65 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  25 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  25.77 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  26.51 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  22.09 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  25.42 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  25.71 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>